В недалеком будущем человечество оказалось вытеснено из всех морей загадочным «Флотом Тумана», состоящим из кораблей, внешне похожих на корабли времен Второй мировой войны, однако обладающих вооружением, намного превосходящими технологии человечества.
Начиная с 2012 года стали поступать сообщения о появлении в Мировом океане кораблей-призраков. Все они появляются из сгустившегося тумана и выглядят как корабли Второй Мировой войны.
В 2038 году корабли-призраки начинают атаковать человеческие суда по всему миру.
Попытки людей дать отпор непонятному агрессору провалились, так как оказалось, что защита и вооружение этих кораблей-призраков настолько превосходят все известные технологии, что человеческое оружие просто не может нанести им никакого существенного вреда. Кроме того, напавшие на человечество корабли-призраки объединены в единую квантовую сеть и достаточно разумны для координации своих действий.
К 2039 году из-за атак кораблей-призраков получивших наименование «Флот Тумана» было потеряно более 5% всего мирового флота. Итогом же стала решающая двухдневная «Великая Битва», в результате которой человечество потерпело сокрушительное поражение, потеряв более 70% боевых кораблей и около 600 тысяч военных моряков. Море для людей закрылось окончательно.
Единственным неоднозначным «успехом» человечества стал захват японскими моряками туманной подлодки I-401 (подлодка всплыла прямо на рейде Йокосуки с неактивными системами).
Вскоре корабли Тумана появляются у берегов, уничтожая любые плавсредства, подводные кабели, трубопроводы, пересекшие береговую черту самолёты... в конце концов дело доходит до спутниковых группировок. Человечество оказывается полностью разобщено и заперто на своих материках (для связи остаются лишь единичные радиостанции на сверхдлинных волнах).
Из-за блокады глобальная экономика рушится, в мире начинается паника, обостряются межгосударственные противоречия, по континентам прокатывается череда военных конфликтов, а островные государства оказываются на грани выживания.
По прошествии лет люди привыкают жить в разобщённом мире, а новое поколение и не помышляет о море. Исключение составляют островные государства, где из-за недостатка ресурсов ситуация с каждым годом становится всё хуже и хуже.
В 2045 году коммандер Шизуо Чихая убеждает правительство Японии разрешить ему использовать захваченную субмарину Тумана для прорыва блокады.
Чихая набирает экипаж, I-401 выходит в море… и исчезает.
Через год I-401 внезапно всплывает на рейде Йокосуки, но на борту у неё никого нет. Что стало с коммандером Чихая и его людьми остаётся неизвестным, подлодку возвращают в сухой док.
В 2054 году перед учащимся Морской академии Японии Гонзо Чихая (сыном Шизуо) появляется Иона, девочка, являющаяся ментальной моделью (аватарой) подлодки I-401. Она сообщает, что у неё приказ: «найти Чихая Гонзо, сына Чихая Шизуо, и выполнять его приказы». Она повторяет эту фразу раз за разом, а на все вопросы Гонзо отвечает, что данный приказ - единственное, что сохранилось в её памяти.
В конце концов Гонзо соглашается отправиться «на борьбу за свободу Человечества» и I-401, взяв его на борт, выходит в море, не обращая внимания на попытки ВМФ Японии её остановить.
В результате анализа прошедшей войны флагманские корабли Тумана осознали, что победа одержана исключительно за счет технологического превосходства, а никак не организации боевых действий. Поскольку сеть Тумана является квантовой в ней отсутствует само понятие времени и, соответственно, все производные от него, такие, как тактика. Следовательно, если бы человечество обладало теми же технологиями, что и Туман, оно бы несомненно победило за счёт своего преимущества в планировании.
Дабы преодолеть этот недостаток крупные корабли Тумана формируют «ментальные модели» - свои персонифицированные воплощения по образцу человеческого тела - для понимания и обработки коцепций «прошлого», «настоящего» и «будущего». За образец берётся женское тело, так как в самом распространённом человеческом языке (английском) слово «корабль» (ship) - женского рода.
В итоге на палубах большинства крупных кораблей Тумана появляются молодые и красивые девушки.